电磁炒药机内部结构污垢的清除应根据设备种类（如中药材炒药机）和污垢特性（如残渣、烧焦物）采用不同方法，根本原则是安全、合理、不损伤设备。以下属于综合性公开信息的清理提议：
制冷与乱倒：待炒药机彻底冷后，开启进料端隔板，用专用软毛刷、铁铲或撮子将内腔残余的残渣、中药饮片等由此可见物彻底消除，放进废料桶。
基本清洗：用生活用水或冷水对内部开展喷洒或清洗，将疏松残余物冲进清理桶，再放入蓄水池。此步骤能防止残余物干枯干固。
当日常清除没法清除难除污渍（如烧焦物、油溶性残余）时，应进行深层清洁：
侵泡变软：向电磁炒药机内加入适量清水，可选择加入食用白醋（硫酸溶液）或专用的食品级塑料/制药业级清洁剂，侵泡几小时乃至留宿。醋能合理变软有机化学残渣，且比较安全。尽量使用硫酸等腐蚀性硫酸液，以免造成设备。
物理学清洗：浸泡后，用软刷、海棉或者非掉毛面料细心清洗内腔。不得使用数控刀片、钢丝刷等硬块刮蹭，以防刮伤内腔，影响设备使用寿命或造成二次污染。
完全清洗：用大量冷水反复冲洗内腔，确保清洁剂和变软之后的污渍残余物都已经被清理干净。
